Nature五连发：评估奥密克戎突变株对药物和抗体的逃逸

2021年11月底26日，联合国（WHO）日前将从新反转株 B.1.1.529 起名为“奥密克戎”，并列作曾受关注反转株（Variant of Concern， VOC），即风险等级最高的从新冠大肠杆菌反转株。不到4周小时，奥密克戎感染者已占全美从附加从新冠感染者数字的至少73%。

12月底23日，Nature 连发5篇关于疫苗喂养和病原体对从新冠大肠杆菌奥密克戎（Omicron）反转株有效特质的论文。

既有的从新冠大肠杆菌疫苗喂养和从新冠大肠杆菌化学合成（小分子并当中和从新冠大肠杆菌的细胞膜质）通过标识从新冠大肠杆菌的刺突细胞膜（S细胞膜）值得注意，刺突细胞膜也是从新冠大肠杆菌用来进入全人类细胞膜的部位。奥密克戎反转株在刺突细胞膜上有达32个特异特质，预计将很快取代当前流行的阿尔法（Delta）论及，但奥密克戎对既有化学疗法和疫苗喂养有效特质的直接影响仍相符。

从新冠大肠杆菌奥密克戎从新品种展示出显露惊人的病原体捕获

耶鲁学院何大一（Did Ho）及合笔记报告称作，从新冠肺结核（COVID-19）疫苗喂养和化学疗法对奥密克戎的特性要一比很多。笔记核查了四种主要的从新冠肺结核疫苗喂养——孟山都-BioNTech的mRNA疫苗喂养、Moderna的mRNA疫苗喂养、艾利森疫苗喂养以及阿斯利康疫苗喂养——在来自54名行动者的样品当中对奥密克戎的当中和活特质，这54名行动者仅有喂养了紧接整的两剂疫苗喂养（其当中15名还喂养了孟山都-BioNTech的mRNA疫苗喂养、Moderna的mRNA疫苗喂养的促进钩）。在所有疫苗喂养类型当中仅有推论到了抗奥密克戎有效特质相对来说减少的周期性，包括在两名曾经感染者过从新冠大肠杆菌的行动者身上亦不例除此以外。不过，在孟山都-BioNTech的mRNA疫苗喂养或Moderna的mRNA疫苗喂养促进钩的行动者样品当中，其病原体当中和率减少持续特质极小。

笔记还研究者了19种钩对奥密克戎反转刺突细胞膜的化学合成的当中和活特质。作准备检验的化学合成包括已获病理批准的化疗病原体，如REGN10987 (imdevimab)、 REGN10933 (casirivimab)、 COV2-2196 (tixagevimab)、 COV2-2130 (cilgimab)、 LY-CoV555 (bamlanivimab)、CB6 (etesevimab)、Brii-196 (amubarvimab)、 Brii-198 (romlusevimab) 以及S309 (sotrovimab)。结果看显露，19种抗肿瘤当显露处17种实质上或以外失去了当中和技能。只有romlusevimab和sotrovimab保有了其当中和活特质。

笔记还报告了奥密克戎刺突细胞膜的四种从新特异特质（S371L、N440K、G446S和Q493R），这些特异特质突显了奥密克戎较之其他从新冠大肠杆菌从新品种更强的病原体抗特质。

从新冠大肠杆菌奥密克戎从新品种对病原体的当中和作用存在大量捕获

法国巴斯德研究者所 Olivier Schwartz 和合笔记从比利时的一名有机体人体内转化了一个奥密克戎大肠杆菌，并深入研究者了该大肠杆菌对于现今已批准病理常用或仍在开发当中的9种化学合成有多敏感特质。

结果推断显露，奥密克戎反转株能实质上抗击或以外抗击检验当中所有化学合成的当中和作用。其当中，5种病原体（Bamlanivimab、Etesevimab、Casirivimab、Imdevimab和Regdanvimab）对奥密克戎无效；2种病原体（Cilgimab和Andintrevimab）对奥密克戎的当中和活特质比它们对阿尔法的活特质下降了达20倍；Sotrovimab抗奥密克戎的活特质比抗阿尔法的活特质下降了达3倍。

在孟山都-BioNTech的mRNA疫苗喂养（16人）或阿斯利康疫苗喂养喂养者（18人）打紧接第二钩五个月底后热带植物的毒素当中，从未扫描到对奥密克戎的抗大肠杆菌活特质。从20名孟山都-BioNTech的mRNA疫苗喂养第三钩喂养者热带植物的毒素样品当中，笔记推断显露对奥密克戎的当中和活特质大幅提高了6倍。在显露现症状后6个月底或12个月底热带植物的40名入院有机体（有感染者简史）的毒素当中，对奥密克戎的当中和活特质要么很低、要么没。不过，在这些入院有机体当中碰到一钩孟山都-BioNTech的mRNA疫苗喂养的22人，其人体内的当中和活特质比没感染者简史的两钩疫苗喂养喂养者极低。

这些初步深入研究者全部基于疫苗喂养喂养者或感染者入院者的毒素，但笔记指显露这些毒素的样品量较少，而且他们只深入研究者了孟山都-生物科技和阿斯利康这两种疫苗喂养。但深入研究者结果看显露，病原体化学疗法或即可钩对奥密克戎紧接成快速优化，且疫苗喂养促进钩也许能增强对奥密克戎的当中和技能。

奥密克戎对孟山都-BioNTech的mRNA疫苗喂养的当中和作用存在相对来说但不实质上的捕获

辛巴威纳塔尔-纳塔尔学院的Alex Sigal及合笔记能用辛巴威19名已喂养过两剂孟山都-BioNTech的mRNA疫苗喂养的辛巴威行动者的血浆样品，核查了奥密克戎是否对病原体当中和存在捕获。其当中六名行动者没从新冠大肠杆菌感染者简史。笔记推论到，与该大肠杆菌最早期的致病相比，疫苗喂养所驱使的对奥密克戎的当中和作用减少了22倍。然而，有过从新冠大肠杆菌感染者简史且喂养了疫苗喂养的行动者样品保有了以外对奥密克戎的当中和活特质，其活特质高度与只喂养过疫苗喂养的行动者对早期从新冠大肠杆菌致病的当中和活特质高度相当。

消毒剂当中和病原体可应对奥密克戎抗原转换

Vir Biotechnology公司的Dide Corti和合笔记的研究者看显露了奥密克戎免疫反应捕获技能或强于之后从新冠大肠杆菌论及的论据。他们扫描了奥密克戎曾介导融合结构域（RBD）与人ACE2曾介导的融合情况——RBD是刺突细胞膜的一以外，能为了让从新冠大肠杆菌进入宿主细胞膜，而ACE2曾介导是RBD的一个主要融合目标。研究者看显露，相较于从新冠早期转化致病，奥密克戎的RBD与人ACE2融合的依赖性有所增强（增强了达2.4倍）。

笔记还研究者了现今钩对从新冠大肠杆菌感染者不太可能获批或正在研发当中的化学合成对于奥密克戎型假大肠杆菌（一种从新冠大肠杆菌模型）的活特质。在研究者检验的8种化疗特质化学合成当中，多数实质上失去了对奥密克戎的当中和活特质；两种化学合成（标靶）的前锋减少100倍左右，一种化学合成（sotrovimab）的前锋减少了3倍。研究者团队还扩充了选取全域，对另除此以外36种当中和病原体也紧接成了选取，接曾受检验的全部44种化学合成当中，只有6种对奥密克戎依然具有引人瞩目的当中和活特质，它们分别是：sotrovimab、S2K146、S2X324、S2N28、S2X259和S2H97。在29种小分子RBD特定全域内（曾介导融合基序）的化学合成当中，有26种对奥密克戎的当中和活特质显露现了在在减少。

研究者人员还比较了疫苗喂养或感染者诱导的病原体抑制奥密克戎假大肠杆菌的活特质和抑制来自重庆的早期从新冠大肠杆菌的假大肠杆菌的活特质。采样小时为疫苗喂养喂养者打紧接最后一钩（除艾利森疫苗喂养除此以外都是两钩）的7-10个月底后。入院期病变或喂养艾利森疫苗喂养（只打一钩）、Sputnik V疫苗喂养或国药疫苗喂养的有机体的血浆对奥密克戎的当中和活特质很低或无论如何没。Moderna、孟山都-BioNTech和阿斯利康疫苗喂养喂养者对奥密克戎的当中和活特质比对从新冠早期转化株的当中和活特质分别减少了33倍、44倍和36倍。

奥密克戎可捕获多数从新冠大肠杆菌既有当中和病原体

北京学院谢晓亮和合笔记能用一种从新选取系统设计插图了奥密克戎刺突细胞膜RBD的特异特质图谱，这些特异特质可使奥密克戎捕获当中和病原体的作用。笔记选取了247种全人类当中和病原体，推断显露奥密克戎能捕获其当中85%以上的病原体。笔记推断显露，这些病原体可根据它们的表位（病原体融合基因座）分成六类（A类至F类），并且奥密克戎RBD上的单个特异特质可能会直接影响不同类别病原体的有效特质。例如，奥密克戎可能用特异特质K417N、G446S、E484A和Q439R捕获A类至D类的病原体，这些病原体的表位与ACE2融合基序有分开。而通常对沙贝大肠杆菌（从新冠大肠杆菌所在大肠杆菌旧属）具有消毒剂当中和活特质的E类和F类病原体则较少曾受到奥密克戎特异特质的直接影响。

笔记还推断显露，奥密克戎能大幅度破坏病原体药物etesevimab-bamlanivimab饮料化学疗法、REGEN-COV饮料化学疗法、cilgimab-tixagevimab饮料化学疗法以及amubarvimab病原体的当中和活特质。不过，化学合成sotrovimab和DXP-604仍然对奥密克戎适合于，却是有效特质可能会下降。

早期显露处：

Lihong Liu， et al. Striking antibody evasion manifested by the Omicron variant of SARS-CoV-2. Nature， 2021.doi： https：//doi.org/10.1038/d41586-021-03826-3.

Delphine Planas， et al. Considerable escape of SARS-CoV-2 Omicron to antibody neutralization. Nature， 2021. doi： https：//doi.org/10.1038/d41586-021-03827-2.

Sandile Cele， et al. Omicron extensively but incompletely escapes Pfizer BNT162b2 neutralization. Nature， 2021. doi： https：//doi.org/10.1038/d41586-021-03824-5.

Elisabetta Cameroni， et al. Broadly neutralizing antibodies overcome SARS-CoV-2 Omicron antigenic shift. Nature， 2021. doi： https：//doi.org/10.1038/d41586-021-03825-4.

Yunlong Cao， et al. Omicron escapes the majority of existing SARS-CoV-2 neutralizing antibodies. Nature， 2021. doi： https：//doi.org/10.1038/d41586-021-03796-6.