Nature:肠道微生物代谢衍生物新功能,促进HDAC3酶活性

2022-02-14 15:54:46 来源:
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哺乳动物寄主和对其有益于的常与有机体的携手进化导致了寄主-有机体彼此间的拓展。表型遗传学修饰使得哺乳动物线粒体并不需要统合外界周围环境频谱,促使线粒体对周围环境的适应性。但是一直以来常与的十二指肠有机体缺少的多种频谱通路和多种周围环境频谱是如何精密调控的还不颇多正确。

十二指肠淋巴线粒体位于有机体群和寄主相互间的图形,促使决定性屏障的形成,在肥胖中期和挫伤中期对十二指肠淋巴进行时可用。维持十二指肠淋巴线粒体分化过程中所有多种表型遗传学程序参与其中所,其中所HDACs的表达出来对于十二指肠稳态非常决定性。十二指肠有机体缺少的短链脂肪酸醋酸水(Butyrate)在粘液抑止HDAC活性,醋酸水处置后的十二指肠组织淋巴线粒体中所HDAC活性下降。在冷藏松鼠中所植入产醋酸水的十二指肠有机体时会抑止十二指肠淋巴线粒体中所HDAC的活性。这些结果都说明十二指肠有机体缺少的醋酸水抑止HDAC的活性。但是十二指肠有机体与转移酶;大羧化酵素相互间的调控程序是怎样的还不得而知。

近日,英国辛辛那提儿童医院医疗中所心Theresa Alenghat研究室在Nature杂志上发表文章 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut,推测十二指肠有机体缺少的鸟苷甲基水并不需要通气十二指肠内转移酶;大羧化酶HDAC3的活性从而促使十二指肠淋巴线粒体的整修,揭露了寄主对于十二指肠有机体频谱作出反应的具体程序。

为了揭露十二指肠有机体衍生细胞内转化与表型遗传学频谱相互间的彼此间,所作们对野生型以及十二指肠淋巴线粒体HDAC3敲除活体中所的HDAC活性进性探测,推测野生型对照组活体中所的HDAC3表达出来但时会并且具有稳定的酵素,但是十二指肠淋巴线粒体HDAC3敲除活体则相反。所作们想知道HDAC3否时会特异性通气十二指肠有机体敏感的频谱正向。所作们推测HDAC1与HDAC2在十二指肠淋巴线粒体中所也有表达出来,但并只能补偿十二指肠淋巴线粒体中所HDAC3表达出来的缺陷。而且在对冷藏松鼠和十二指肠淋巴线粒体HDAC3敲除活体中所的十二指肠淋巴线粒体施用HDAC广谱抑止剂处置后,推测在HDAC3敲除后其他种类的HDACs仍然具有活性。这些结果说明十二指肠有机体促使淋巴线粒体中所HDAC3在但时会十二指肠稳态中所的酵素。

为了破译十二指肠有机体酪氨酸HDAC3的具体程序,所作们对冷藏松鼠和但时会培养的活体中所十二指肠淋巴线粒体中所的转录谱进行时解。所作们推测在十二指肠有机体存在的淋巴线粒体中所与鸟苷甲基细胞内相关的基因被为广泛正向表达出来。前人的研究推测鸟苷三甲基(Inositol trisphosphate)时会通过强化HDAC3与酪氨酸复合物的相互发挥作用来增加HDAC3的活性。所作们推测外加鸟苷三甲基的确时会特异性增加HDAC3-NcoR重转移酶的活性,NcoR复合物对于HDAC3的;大羧化酵素非常决定性。

更进一步地,所作们想知道冷藏松鼠与对照组的活体十二指肠相互间鸟苷三甲基技术水平否存在差异。所作们推测对照组活体中所无论是肠腔还是十二指肠淋巴线粒体中所鸟苷三甲基的技术水平都孝着很低冷藏松鼠,说明十二指肠有机体的存在促使鸟苷三甲基技术水平的增加。为了评估鸟苷三甲基对于十二指肠淋巴线粒体中所HDAC3活性的影响,所作们对十二指肠淋巴线粒体中所的HDAC3复合物进行时纯化并与鸟苷三甲基进行时携手孵育,推测鸟苷三甲基的确并不需要增加内源HDAC3的活性。而且醋酸酮造成的HDAC3活性的抑止也可以被鸟苷三甲基所抑制作用。另外,所作们还推测常与的十二指肠有机体时会通过鸟苷六甲基(Phytate)细胞内捷径促使十二指肠淋巴线粒体中所的HDAC3的基本功能。与鸟苷三甲基相似,鸟苷六甲基也时会正向十二指肠淋巴线粒体中所的HDAC3的活性。

为了探测十二指肠有机体鸟苷六甲基依赖的细胞内对于HDAC活性的影响,所作们对定植野生型以及鸟苷六甲基酶缺陷型酿酒酵母的活体进行时分析。所作们推测定植鸟苷六甲基酶但时会表达出来酿酒酵母的活体相较于冷藏松鼠以及鸟苷六甲基缺陷型酿酒酵母活体的鸟苷三甲基技术水平升高。对活体进行时右旋糖酐酮钠(Dextran sodium sulfate, DSS)处置后,时会正向活体产生十二指肠疾病。为了探测鸟苷三甲基在DSS处置正向的十二指肠疾病中所的发挥作用,所作们对冷藏松鼠施用鸟苷三甲基后推测鸟苷三甲基并不需要促使十二指肠从疾病中所恢复并增加冷藏松鼠的寿命。DSS正向的细菌性类似于病人中所溃疡性细菌性。为了更进一步确认十二指肠有机体细胞内转化的基本功能,所作们对全人类统合有机体组学计划书(Integrative Human Microbiome Project)中所的肥胖样本以及溃疡性细菌性患者的样品进行时探测,推测在溃疡性细菌性病人十二指肠中所鸟苷六甲基酶的稀土元素远低于肥胖样本之中所,说明鸟苷六甲基对于十二指肠挫伤整修是必须的。

总的来说,Alenghat研究室的工作推测相较于冷藏松鼠,十二指肠有机体存在的活体中所HDAC3活性孝着降低,这一降低是通过常与的十二指肠有机体比如酿酒酵母鸟苷六甲基以及鸟苷三甲基的细胞内形成的。另外,鸟苷三甲基时会正向病人缺少的十二指肠类器官的湿润、刺激HDAC3依赖的线粒体增殖以及抑制作用醋酸酮引起的十二指肠湿润抑止,时会促使十二指肠疾病中所淋巴线粒体的整修。因此,所作们鉴定推测了HDAC3作为寄主作出反应多种十二指肠有机体频谱的集聚表型遗传学因子的极为重要基本功能,揭露了十二指肠有机体、表型遗传学因子以及有机体细胞内转化在十二指肠淋巴以及十二指肠疾病中所的极为重要调控和整修发挥作用。

零碎出处:

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.

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