Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中细菌表观表型标记的存在

2021-11-03 06:08:53 来源:
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导言:在早期过渡期,自然界就开始了在不扭转病菌肝细胞DNA该组织时序的必要下来使其DNA发挥各有不同的功能,而这就是通过给DNA核苷酸上加进化学上标来实现的。DNA磷酸化是爬行动可作的关键表型遗传学机制,其里面5-酮胞嘧啶(5mc)是最类似于的DNA词句之一。6mdA是病菌允许性词句系统的基本组合成成分,目前在爬行动可作里面不够推断的允许性词句系统。先前有不少研究课题引述,6mdA也实际上于爬行动可作里面,但并无论据支持。

近日,在《自然科学进展》上的一项研究课题里面,丹麦林雪平大学的研究课题管理人员证明,爬行动可作肝细胞里面实际上病菌表型遗传学上标很似乎被水污染了,并且不能足够的论据来确实爬行动可作里面实际上这种词句。

N6-酮腺嘌呤(6mdA)是病菌里面广泛的DNA词句,但最近在爬行动可作DNA里面也得到了连续性。然而,研究课题管理人员提到,即使对来自不尽相同爬行动可作肝细胞类型的DNA进行的6mdA除此以外和原子量量度研究课题也不完全一致。

为了全面阐明6mdA在爬行动可作由此可知规格里面的起着,研究课题管理人员利用了肾脏将本能幼稚T辅助(NTH)肝胚胎成为TH肝细胞亚群的能力。但是,与先前的研究课题显然,他们推断出TH分化成反复里面6mdA的原子量不能1]变化,并且捕捉到到分化成的T肝细胞里面的6mdA程度与从未磷酸化的全DNA扩增DNA不尽相同,这证明6mdA没有以可检验的程度实际上本能T肝细胞里面。

他们还分析了从六个本能肝细胞系里面分离出的DNA里面的6mdA,并鉴定出两个具有高于背景噪声程度的6mdA程度的肝细胞系。出乎意料的是,两种单独的293T肝细胞系培养可作具有各有不同的6mdA程度,这证明研究课题管理人员捕捉到到的6mdA瞬时并非肝细胞类型本身固有的。似乎,当他们全面看时,他们推断出两条6mdA程度上升时的肝细胞系被支原体同属水污染,支原体同属一种类似于的病菌肝生可作膜可作里面极其丰富6mdA的水污染可作。当他们用支原体磷酸化药可作Plasmocin检视肝细胞系时,6mdA瞬时降低为A阴性对照。

“我们意识到通过这些技术检验到的6mdA'瞬时'只是噪声。但是,由于一些简单的技术问题,几种作法里面的背景噪声不是随机的,而是真实瞬时。”见习作者Colm Nestor(科尔姆·内斯特)在一份公开信里面知道。

研究课题管理人员分析了那时候通过DNA免疫沉淀化学合成、质谱和单水分子实时化学合成在爬行动可作肝细胞里面适配或检验6mdA的努力。人们推断出每种作法都有局限性或缺陷,使表型遗传学上标的骗白血病推断出率很高,似乎证明林雪平研究课题管理人员忽视不实际上这种现象的论据。

这组作者提到:“我们确实,RNA和病菌水污染、抗体交叉反应性和其他技术允许的转化已导致6mdA在爬行动可作DNA里面的间歇错误识别。随着DNA和RNA词句家系的不断增长,以及那时候从未知词句的特殊性越来越罕见,即使用于多种互补作法,我们也凸显了错误推断出的似乎性。我们劝告用于词句和从未词句的DNADNA标准化作为今后对比较丰富DNA词句的研究课题的上限拒绝,以及在用于前更全面地实验者抗体磷酸化。”

内斯特补充知道,研究课题管理人员在研究课题极其罕见的现象时不必极其小心,选择用于哪种作法,并选择他们是否真正在量度实际上的事可作。他知道:“现在我们可以毫无疑问地知道爬行动可作里面不实际上6mdA。关于6mdA,如果研究课题管理人员暂时研究课题根本不实际上的东西,则可以节省大量时间和金钱,并且能避免了很多令人失望的坏事。”

原始来历:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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